创世纪转基因技术有限公司注册资本8000万元，总资产约2亿元。公司主要股东为深圳东方明珠（集团）股份公司、北京奥瑞金种业股份公司、农科院生物技术研究所，主要经营植物功能基因研究，棉花新品种选育、生产、加工、销售及技术服务等业务；拥有我国大规模产业化的转基因农作物（抗虫棉）的核心技术专利。国家发改委评定公司转基因抗虫棉产业化项目为“高新技术产业示范工程”。2008年，公司被认定为“高新技术企业”和广东省“农业龙头企业”，连续两年获深圳市政府“科技创新奖”奖励。2009年，公司的生物技术中心被深圳市政府认定为“深圳转基因植物研究开发中心”；公司通过了ISO9000质量管理体系认证；转基因抗虫棉产业化关键技术的研究与应用”、“新型抗棉铃虫转基因棉花研究”被农业部列为国家转基因生物新品种培育重大专项课题。2010年公司植物分子检测平台获深圳市政府立项资助。
公司采取自主研发和合作研发相结合的方式，拥有抗虫基因、耐盐基因、抗除草剂基因等多项发明专利。目前公司又有“人工改造合成的杀虫基因及其编码的蛋白质与应用”及“人工改造合成的抗草甘磷基因及其应用”等五项专利申请目前已经进入受理或实质审查阶段。公司自主和合作培育了“创杂9”、“创杂20”、“创杂21”、“创杂27”、“创杂28”、“创鲁1号”等十余个抗虫棉新品种。公司在深圳已建成配备国内仪器设备的分子生物学、细胞生物学、基因检测室、生物学信息室等实验室,正在深圳龙岗建设大型转基因植物试验转导基地。公司还适应各棉区不同生态特征，在湖北、河北、海南、新疆、巴基斯坦等地建立了棉花育种实验站。
公司建立了完善的组织管理结构，下设生物技术中心、育种、生产、加工、品管、营销、棉花经营、行政、财务、事务等部门。截至2010年2月底，公司共有员工264人，其中获博士学位（或高级职称）13人，大学本科（或中级职称）以上员工占员工总数60％以上。公司管理规范，2009年被市政府认定为“劳动关系和谐企业”。
公司积极进行抗虫棉技术的产业化，已建成棉花制种基地近5万亩，成为国内大的棉花种子经营企业之一。公司已投资建成河北黄骅、河南郑州，新疆库尔勒加工厂。各加工厂建成一套加工能力为每小时2－3吨的大型棉花种子硫酸脱绒、精选、包衣、包装和仓储自动化生产线。加工厂建立棉种质量监测与控制体系，推行ISO9001质量管理标准。
公司已在湖北、安徽、河北、河南、山东、新疆等地建立大区营销中心，经营“创杂棉21”、“鄂杂棉11”、“鲁棉研23”、“冀棉616”等二十余个棉花新品种，经销商500余家，遍布我国长江流域、黄河流域、新疆内陆等三大棉区。此外，经创世纪公司授权使用抗虫棉专利技术的科研单位和企业达70余家，打破了美国孟山都公司转基因抗虫棉技术在我国早期的技术垄断格局，创造了的社会效益。
公司还积极实施化战略，已经与印度、菲律宾、越南、巴基斯坦、缅甸等国建立了合作关系。在市场的成功表现，使公司成为我国加入WTO后农业生物技术领域进军市场的先驱。